Durant la période Edo (1603 – 1868), les postes de garde portuaires appelés « funabansho » permettaient de surveiller les bateaux entrant et quittant un port. Le funabansho de Tomonoura fut construit au début de la période Edo au sommet d’un mur de pierres à l’extrémité est du port, sur Taigashima, qui fut autrefois une île mais qui est aujourd’hui reliée à Tomonoura.

Le bâtiment que l’on peut voir aujourd’hui a été reconstruit, mais le mur de pierres sur lequel il est construit date encore de la période Edo. Le clocher qui se trouve près du funabansho servait autrefois à indiquer l’heure et à donner l’alarme en cas d’urgence.